El Grupo Epidemiológico Matemático para la Vigilancia de Epidemias y Pandemia (GEMVEP) de la Universidad de Santiago publicó su 40º informe de Análisis Regional y Comunal, que usa los datos publicados en el Informe Epidemiológico del Ministerio de Salud del Lunes 21 de Junio, para el cálculo de indicadores que se basan en los casos nuevos de las semanas epidemiológicas 23 y 24 del año 2021.
En este informe destacamos que por segunda semana consecutiva los casos totales (confirmados y probables) disminuyen en Chile. En esta semana estimamos una disminución de los casos con inicio de síntomas en la semana epidemiológica 24 (13 al 19 de Junio) de un 13.6% respecto a la semana previa. De esta manera, los casos han disminuido en un 23.0% en las últimas dos semanas en Chile, una baja que puede verse alterada en el contexto de desconfinamiento y de llegada de variantes más transmisibles, como Delta.
La tasa de casos nuevos estimada en el país en esta semana es de 243.7 casos cada 100.000 habitantes. La tasa de casos nuevos totales estimada en esta semana es similar a la observada a inicios de Mayo (Semana Epidemiológica 17 y 18 con 241.8 y 241.1 casos cada 100.000 habitantes) y en la segunda semana de Marzo (244.8 casos cada 100.000 habitantes del 7 al 13 de Marzo).
Además, esta tasa de casos es 3.5 veces mayor a los 10 casos diarios cada 100.000 habitantes que es el límite de tolerancia para salir de un nivel crítico de contagios.
La tasa de casos activos estimada en esta semana es de 403.5 casos cada 100.000 hab. En el último informe epidemiológico publicado por el ministerio se informaron 243.45 casos cada 100.000 hab. De esta manera, estimamos un subreporte de casos activos (debido al rezago en el reporte) de un 39.66%.
La Región Metropolitana ha contribuido de manera importante a la disminución de casos en Chile. En esta región, la baja de los casos totales la estimamos en un 18.9% en la última semana, acumulando una baja de un 30.8% de los casos en las últimas dos semanas.
De esta manera, en la Región Metropolitana estimamos una tasa de casos nuevos de 253.7 casos cada 100.000 habitantes. Pese a las fuertes bajas de casos, la tasa de casos nuevos en esta región está 3.6 veces sobre el límite de tolerancia para salir de un nivel crítico de contagios.
Por otra parte, en regiones la disminución de casos fue más leve. En las regiones los casos disminuyeron en un 9.0% en la última semana, acumulando una baja de un 15.8% en las últimas dos semanas y de un 18.6% en los últimos 21 días. La tasa de casos nuevos totales estimada en regiones es de 236.5 casos cada 100.000 habitantes, 3.4 veces sobre el límite de tolerancia.
En el desglose regional, estimamos que sólo 2 de las 16 regiones del país aumentaron sus casos en la última semana. Estas regiones son:
- Arica (+9.1%)
- Antofagasta (+1.6%)
Además, 13 regiones disminuyeron sus casos. Entre estas regiones, destacamos que las que han disminuido de manera más fuerte sus casos en la última semana son las regiones de Ñuble (-19.2%), Metropolitana (-18.9%) y O'Higgins (-17.7%).
Respecto a los contagios por 100.000 habitantes en la semana epidemiológica 24 de este año, estimamos las mayores tasas de casos nuevos en las regiones de:
- Aysén 427.8 casos cada 100.000 habitantes
- Los Ríos 385.9
- Atacama 272.6
- Coquimbo 258.7
- Valparaíso 258.0
- Araucanía 257.8
En este informe estimamos más de 100 casos nuevos por 100.000 habitantes en las 16 regiones del país.
La región con la menor tasa de casos nuevos del país es Magallanes con 129.5 casos cada 100.000 habitantes, 1.85 veces mayor al límite de tolerancia para salir de un nivel crítico de contagios.
Respecto al subreporte de casos activos, las regiones con mayores porcentajes de subreporte en este informe fueron:
- Valparaíso 42.8% de subreporte de casos activos
- Metropolitana 42.5%
- Coquimbo 40.9%
- Magallanes 39.7%
- Araucanía 39.4%
- Los Lagos 39.1%
Exámenes PCR
Los exámenes PCR informados en la semana 24 disminuyeron respecto a la semana previa en un 2.3%. En esta semana se informaron 452.082 exámenes PCR en Chile, valor menor al observado en las dos semanas previas.
A nivel regional, 11 regiones disminuyeron sus exámenes PCR en la última semana móvil. La región que más aumentó sus exámenes PCR en la última semana móvil fue Antofagasta con alza del 4.3.
Por otra parte, las regiones que más disminuyeron sus exámenes PCR fueron:
- Atacama -26.8%
- Metropolitana -12.4%
- Los Lagos -8.6%
- Bío Bío -5.5%
Análisis Comunal
En el desglose comunal nos preocupan los indicadores de las siguientes comunas:
Escala de Trazabilidad
Esta semana tuvimos una buena noticia con la trazabilidad. Finalmente, se observó el primer aumento importante desde Marzo en razón de contactos por caso en Chile y en la RM. De esta manera, en Chile se encuentran 2.8 contactos por cada caso confirmado (+0.2 que semana previa). Además, en la Región Metropolitana la razón de contactos por caso subió a 2.2.
Las regiones con mayor trazabilidad del país en este nuevo informe son:
- Ñuble 5.1 contactos por caso confirmado
- Coquimbo 4.4
- Araucanía 3.6
- Maule 3.5
Por otra parte las regiones con menor trazabilidad del país son:
- Metropolitana 2.2 contactos por caso
- Aysén 2.5
- Los Lagos 2.5
- Los Ríos 2.7
A nivel comunal, los municipios con menor trazabilidad continúan siendo de la Región Metropolitana. En esta lista entra esta semana Renca, comuna que habitualmente estaba entre las mejores de esta región. Creemos que su alta incidencia de casos puede ser la razón de esta baja trazabilidad.
Entre las comunas con más de 25.000 habitantes destacamos a continuación las que tienen mayor y menor valor de este indicador según el último informe de trazabilidad y testeo.
10 comunas nacionales con mejor trazabilidad:
- San Carlos
- Coihueco
- Salamanca
- Monte Patria
- Mulchén
- Illapel
- Casablanca
- Hualqui
- Parral
- Santa Cruz
10 comunas nacionales con menor trazabilidad:
- Calera de Tango
- Renca
- Curacaví
- Peñaflor
- San Ramón
- Recoleta
- La Reina
- Santiago
- Independencia
- Pirque
Todas con menos de 2 contactos por caso.
10 comunas metropolitanas con mejor trazabilidad:
- San José de Maipo
- Isla de Maipo
- Conchalí
- Quilicura
- La Cisterna
- Melipilla
- Buin
- Pudahuel
- Til Til
- María Pinto
Todas con al menos 2.65 contactos por caso.
En el análisis de trazabilidad, ponemos particular interés en la razón de contactos por caso confirmado. Este indicador corresponde al número de contactos que son localizados por cada persona con PCR positivo detectada.
La idea es que ese valor sea por lo menos entre 3 ó 4 contactos, pues se asume que una persona contagiada tiene al menos esos contactos en su núcleo familiar y el valor recomendado para que el trabajo de trazabilidad sea considerado exitoso es entre 5 a 10 contactos por cada PCR+ confirmado.
Indicadores usados:
R Instantáneo: La tasa de reproducción instantánea fue calculada a nivel comunal usando el método de Cori implementado en el paquete EpiEstim de R.
Tasa de Casos Activos es calculada cada 100.000 habitantes como los casos de las semana epidemiológica 24 + 4/7 de los casos de la semana epidemiológica 23 y corregida por el rezago en el reporte usando el método de Yan & Chowell.
Variación de Casos Estimados: Corresponde a la variación relativa de casos en la semana epidemiológica 24 respecto a la semana epidemiológica 23 del año 2021.
Semana Epidemiológica 24-2021: 13 de Junio al 19 de Junio
Semana Epidemiológica 23-2021: 06 de Junio al 12 de Junio
Para la creación del semáforo y la etiqueta de comunas en Rojo, Verde y Amarillo se usa un procedimiento de cluster que se basa en los indicadores anteriormente mencionados.
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