El Grupo Epidemiológico Matemático para la Vigilancia de Epidemias y Pandemia (GEMVEP) de la Universidad de Santiago publicó su 32º informe de Análisis Regional y Comunal, que usa los datos publicados en el Informe Epidemiológico del Ministerio de Salud del Lunes 26 de Abril, para el cálculo de indicadores que se basan en los casos nuevos de las semanas epidemiológicas 15 y 16 del año 2021.
En este nuevo informe, estimamos una leve disminución de los casos totales (confirmados y probables) en el país de un 1.7% en la semana epidemiológica 16. Es decir, el descenso de los casos en la última semana ha sido lenta.
Debido a esta disminución de casos, la tasa de casos nuevos en esta semana que estimamos en el país es de 295.0 casos por 100.000 habitantes. Esta tasa de casos nuevos es la más baja que hemos observado en el país desde la semana epidemiológica 11 (14 al 20 de Marzo). Sin embargo, la tasa de casos actual es casi el doble de la que teníamos hace 10 semanas en el país (153 casos cada 100.000 habitantes en la semana epidemiológica 6).
Además, la tasa de casos activos que estimamos es de 466.4 casos por cada 100.000 habitantes. En el último informe epidemiológico publicado por el ministerio se informaron 269.43 casos por 100.000 habitantes. De esta manera, estimamos un subreporte de casos activos (debido al rezago en el reporte) de un 42.23%.
La disminución de casos en esta semana está explicada por una baja de los casos nuevos en las regiones del país. En las regiones los casos disminuyeron en un 3.9% respecto a la semana anterior. Debido a esto la tasa de casos nuevos estimada es de 300.5 casos cada 100.000 habitantes. En la Región Metropolitana, en cambio, estimamos un leve aumento de los casos de un 1.5% respecto a la semana previa. La tasa de casos nuevos totales estimada para esta región es de 287.3 casos cada 100.000 habitantes.
En el desglose regional, estimamos en este informe aumentos de casos en 7 de las 16 regiones del país. Las regiones con las mayores alzas son
- Aysén (+55.2%)
- Arica (+11.3%)
- Magallanes (+6.5%)
- Tarapacá (+4.3%)
Entre las regiones que disminuyeron sus casos en la última semana destacamos a la región de Los Ríos con una disminución de los casos de un -20.4% respecto a la semana anterior.
Además, respecto a los contagios por 100.000 habitantes en la semana epidemiológica 16 de este año, estimamos las mayores tasas de casos nuevos en las regiones de:
- Araucanía 446.3 casos nuevos cada 100.000 habitantes
- Magallanes 431.1
- Maule 392.3
- Tarapacá 364.7
- Arica 344.3
- Atacama 322.8
- Los Ríos 315.9
En este informe estimamos más de 100 casos nuevos por 100.000 habitantes en las 16 regiones del país. La región con menor tasa de casos nuevos fue Coquimbo con 167.3 casos por 100.000 habitantes.
Exámenes PCR
La disminución de casos de esta semana, se da en un contexto en que los exámenes PCR cayeron en un 5% en el país en la semana epidemiológica 16 respecto a la semana anterior. Además, en la última semana móvil los exámenes han caído en un 9.1% en el país. Esta baja de exámenes PCR se observó en 14 de las 16 regiones del país. La única región que aumentó sus exámenes respecto a la semana previa es Magallanes (+15%). Las regiones que más disminuyeron sus exámenes PCR en la última semana móvil fueron:
- Ñuble (-27.3%)
- O’Higgins (-14.7%)
- Metropolitana (-14.0%)
- Maule (-8.9%)
Análisis Comunal
En el desglose comunal nos preocupan los indicadores de las siguientes comunas:
Escala de Trazabilidad
La trazabilidad en el país se mantuvo esta semana respecto a la semana previa. En el último informe de Testeo, Trazabilidad y Aislamiento se informó que se detectaron 2.6 contactos por cada caso confirmado a Nivel País, igual valor de la semana anterior.
Por segunda semana consecutiva el podio de peor trazabilidad nacional está compuesto únicamente por comunas de la Región Metropolitana. En esta región, entre las comunas de mejor detección sólo dos superan los 3 casos, las restantes ocho encuentran entre 2, 52 y 2,90 contactos, inferior al mínimo de 3 a 4 casos esperado.
Las regiones con mayor trazabilidad del país en este nuevo informe son:
- Coquimbo 4.4 contactos por caso confirmado
- Araucanía 3.6
- Biobío 3.3
- Ñuble 3.2
Por otra parte las regiones con menor trazabilidad del país son:
- Metropolitana 2.1 contactos por caso.
- Atacama 2.3
- Los Lagos 2.3
- Maule 2.5
- Los Ríos 2.5
Entre las comunas con más de 25.000 habitantes destacamos a continuación las que tienen mayor y menor valor de este indicador según el último informe de trazabilidad y testeo.
10 comunas nacionales con mejor trazabilidad: Santa Cruz, Cañete, Pucón, Lebu, La Serena, Villarrica, Chimbarongo, Pitrufquén, Nueva Imperial e Illapel. Todas con al menos 4.29 contactos por caso confirmado.
10 comunas nacionales con menor trazabilidad: Las 10 comunas con peor trazabilidad del país según último informe TTA nuevamente son de la RM: Curacaví, Pedro Aguirre Cerda, Recoleta, Quilicura, San Miguel, Calera de Tango, El Bosque, Isla de Maipo, Pirque y El Monte. Todas con menos de 1.75 contactos por caso.
10 comunas metropolitanas con mejor trazabilidad: Alhué, Buin, Renca, Conchalí, Padre Hurrtado, La Cisterna, Huechuraba, Melipilla, Lo Barnechea y Maipú. Todas con más de 2.5 contactos por caso.
Análisis de trazabilidad:
En el análisis de trazabilidad, ponemos particular interés en la razón de contactos por caso confirmado. Este indicador corresponde al número de contactos que son localizados por cada persona con PCR positivo detectada.
La idea es que ese valor sea por lo menos entre 3 ó 4 contactos, pues se asume que una persona contagiada tiene al menos esos contactos en su núcleo familiar y el valor recomendado para que el trabajo de trazabilidad sea considerado exitoso es entre 5 a 10 contactos por cada PCR+ confirmado.
Indicadores usados:
R Instantáneo: La tasa de reproducción instantánea fue calculada a nivel comunal usando el método de Cori implementado en el paquete EpiEstim de R.
Tasa de Casos Activos es calculada como los casos de las semanas epidemiológicas 14 y 15 del año 2021 cada 100.000 habitantes y corregida por la subestimación en el rezago en el reporte usando el método de Yan & Chowell.
Variación de Casos Estimados: Corresponde a la variación relativa de casos en la semana epidemiológica 16 respecto a la semana epidemiológica 15 del año 2021.
Semana Epidemiológica 16-2021: 18 al 24 de Abril
Semana Epidemiológica 15-2021: 11 al 17 de Abril
Para la creación del semáforo y la etiqueta de comunas en Rojo, Verde y Amarillo se usa un procedimiento de cluster que se basa en los indicadores anteriormente mencionados.
Imagen: análisis de muestras PCR en Magallanes. Ministerio de Salud.
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