Máquina del tiempo: Tasa de Casos Nuevos se Acerca a Cima de la Pandemia en Junio

GEMVEP aumento casos COVID-19



El Grupo Epidemiológico Matemático para la Vigilancia de Epidemias y Pandemia (GEMVEP) de la Universidad de Santiago publicó su 24º informe de Análisis Regional y Comunal, que usa los datos publicados en el Informe Epidemiológico del Ministerio de Salud del Lunes 25 de Enero, para el calculo de indicadores que se basan en los casos nuevos de las semanas epidemiológica 2 y 3 del año 2021.


En tercera semana epidemiológica del año 2021 estimamos un nuevo aumento de casos de Covid-19 de un 7.6% respecto a la semana anterior, lo que acumulado alcanza un aumento de los casos de un 114.7% en el país en las últimas 5 semanas. Así esta semana tenemos más del doble de casos de Covid-19 en el país que antes de las fiestas de fin de año. 


A ello se suma que la tasa de casos nuevos es de 183 casos por 100.000 habitantes a nivel nacional, la más alta desde la semana epidemiológica 24 (7 a 13 de Junio), cuando se registraron 192. La cima de casos en todo lo que llevamos de pandemia fue durante la semana 23, con 215 casos.


En total, estimamos aumentos de casos en 14 de las 16 regiones del país. Solo disminuyeron los casos en Tarapacá (-3.0%) y Maule (-5.4%).  Las mayores alzas fueron en :

  • Magallanes (21.5%)

  • Coquimbo  (19.4%)

  • O’Higgins (18.9%)

  • Los Ríos (14.8%)

  • Los Lagos (13.4%)  

  • Arica y Parinacota (11.6%)

Además, en la tercera semana del año 2021 estimamos la mayor tasa de casos nuevos en la región de Los Lagos. En esta región estimamos 620 casos nuevos por 100.000 habitantes en esta semana. Además, estimamos altas tasas de casos nuevos en las regiones de Magallanes (488), Los Ríos (434), Tarapacá (426), Antofagasta (332) y Araucanía (247). Además, en 15 de las 16 regiones estimamos más de 100 casos nuevos por 100.000 habitantes en la última semana. Solo la Región Metropolitana (90 casos por 100.000 habitantes) esta bajo ese umbral. 

Respecto a las mayores tasas de casos nuevos cada 100.000 habitantesen la tercera semana del año 2021 ocurrieron en:

  • Los Lagos 620
  • Magallanes 488
  • Los Ríos 434
  • Tarapacá 426
  • Antofagasta 332
  • Araucanía 247

Además, en 15 de las 16 regiones estimamos más de 100 casos nuevos por 100.000 habitantes en la última semana. Sólo la Región Metropolitana está bajo ese umbral, con 90 casos por 100.000 habitantes.

Los Lagos y Quellón

Con base en estos indicadores, la región en la que mantenemos mayor preocupación es Los Lagos. Al igual que en las últimas 4 semanas, acá estamos en presencia de la mayor cantidad de casos desde el inicio de la pandemia. 


Su tasa actual de casos por semana epidemiológica de inicio de síntomas en Los Lagos (620 casos por 100.000 habitantes) es la segunda más alta que ha tenido cualquier región desde el inicio de la pandemia, sólo sobrepasado por el pico de Magallanes


A esto hay que sumar que el último dato del nivel de ocupación de camas UCI en la región es de un 94.12% y que su trazabilidad es la tercera peor del país, con sólo 2.2 contactos detectados por caso confirmado. En resumen, la situación es crítica en la región de Los Lagos. 


La alza de la última semana en esta región está explicada por fuertes aumentos de casos en la Provincia de Chiloé, donde destacan los aumentos de casos en las comunas de Quellón y Castro. 


En Quellón estimamos un aumento de los casos de un 240% en la última semana y un R efectivo de 1.44, mientras que en Castro estimamos un aumento de los casos de un 57% en la última semana y un R efectivo de 1.22En ambas localidades estimamos tasas de casos activos mayores a los 1.000 casos por 100.000 habitantes


Quellón es esta semana la comuna de más de 25.000 habitantes con mayor cantidad de casos nuevos por 100.000 habitantes a Nivel Nacional, más del triple de casos que la comuna que le sigue,  Tocopilla. La ciudad concentra la mayor cantidad de salmoneras de la isla de Chiloé, industria que más ha aportado al número de casos confirmados COVID-19. 


Pese a ello y a la Cuarentena, industrias y plantas de proceso se han negado a paralizar faenas. El viernes pasado hubo una huelga de brazos caídos porque trabajadores que eran contactos estrechos COVID-19 fueron obligados a trabajar. El resultado fue el despido de 15 empleados de las empresas Los Fiordos y Yadrán, según confirmó a Vocería Virtual el dirigente de la Federación Nacional de Trabajadores del Salmón (Fenatrasal), Gustavo Cortés.


Otra comuna de la región de Los Lagos que nos preocupa es Osorno, donde estimamos un aumento de los casos de un 7% en la última semana, con un R efectivo de 1.04 y una tasa de casos activos de 937 por 100.000 habitantes.  


Además, Osorno es la comuna de más de 25.000 habitantes con peor trazabilidad del país, sólo se encuentran 1.2 contactos por caso confirmado. 


A nivel nacional, entre las 10 comunas sobre 25.000 habitantes con más casos nuevos estimados por 100.000 habitantes, 5 pertenecen a la Región de Los Lagos: 

  • Quellón (3.125)
  • Calbuco (789)
  • Castro (729)
  • Puerto Montt (501)
  • Osorno (485)




Zona Sur


Siguiendo en el sur del país, la segunda y tercera regiones con mayor tasa de casos nuevos en la última semana son Magallanes y Los Ríos. Además, en Magallanes estimamos el aumento más grande de casos nuevos del país, que es explicado por un alza de 33% en Punta Arenas, que tiene también una tasa de casos activos de 778 por 100.000 habitantes. 


En las últimas 4 semanas la tasa de casos en Magallanes no ha bajado de los 400 casos por 100.000 habitantes, lo que nos preocupa ya que, a más de 4 meses de su cima de casos, aún no llegan a un nivel bajo de contagios, y porque además tiene la mayor tasa de casos acumulados y la mayor tasa de mortalidad desde el inicio de la pandemia. Hay que recordar que la comuna de Punta Arenas se encuentra en Fase de Transición desde el pasado 17 de Diciembre.

 

En la Región de Los Ríos, los casos aumentaron fuertemente en Corral, Lanco, Mariquina y Panguipulli en la última semana. 


Además, en La Unión estimamos un aumento de casos de un 34% en la última semana, con un R efectivo de 1.1 y una tasa de casos activos estimados de 747 por 100.000 habitantes. 


Valdivia no presentó una variación significativa de casos respecto a la semana anterior, pero el R efectivo se mantiene sobre 1 y la tasa de casos activos estimada es de 887 por 100.000 habitantes. 


En la región de Los Ríos, el gran problema es la ausencia de trazabilidad. Nuevamente tiene el peor indicador de trazabilidad del país entre las regiones y La Unión y Valdivia están entre las 10 comunas con la peor trazabilidad nacional. 


Finalmente, para cerrar el análisis de las regiones del Sur, nos preocupa un nuevo aumento de casos estimado en la Región de la Araucanía,  de 11.2% en la última semana. Este aumento, está parcialmente explicado por un nuevo aumento de casos en la comuna de Temuco, que registró un alza de los casos de un 17%, con un R efectivo de 1.04 y una tasa de casos activos de 556 por 100.000 habitantes. 


También en esta región nos preocupa la comuna de Pucón. En la última semana estimamos un aumento de los casos de un 12%, con un R efectivo de 1.52 y una tasa de casos activos de 930 por 100.000 habitantes. 


Otras comunas en las que estimamos aumentos fuertes son  Cunco, Curarrehue, Lautaro, Vilcún, Angol, Collipulli y Purén. Debido a estos aumentos, desde mañana Sábado retrocede a Cuarentena la comuna de Vilcún, mientras que las comunas de Cunco y Collipulli retroceden a Transición. 


Además, la comuna de Padre las Casas también retrocede a Cuarentena, sin un aumento significativo de casos pero con una tasa de casos activos de 447 por 100.000 habitantes. 


Finalmente, en la región de la Araucanía nos preocupa el nivel de ocupación de camas UCI. Según los últimos datos publicados por el Ministerio de Salud, alcanza el 99%.


Zona Norte 


En el norte del país, nuestra mayor preocupación está en la Región de Antofagasta, donde estimamos un aumento de los casos de un 3.6% en la última semana, que está explicado por la fuerte alza de casos en Tocopilla.  En esta comuna, estimamos un aumento de los casos de un 252% en la última semana con un R efectivo de 2.36 y una tasa de casos activos superior a los 1.000 por 100.000 habitantes. 


En Antofagasta y Calama no estimamos aumentos significativos, pero en ambas  aún estimamos un R efectivo mayor a 1


Sin embargo, Antofagasta es nuevamente la comuna con más casos nuevos en el país,  1.619 casos en la tercera semana del año 2021, seguida por Tocopilla


En Antofagasta la disponibilidad de camas UCI es también crítica: 98.3% según el último reporte.


En las regiones de Atacama y Coquimbo estimamos aumentos importantes en la última semana. 


En Atacama, estimamos un aumento de casos de un 2.4% en la última semana, que es explicado por una fuerte alza en las comunas de Caldera y Tierra Amarilla. En Caldera estimamos un aumento de los casos de un 253% en la última semana, con un R efectivo de 1.36 y una tasa de casos activos estimada de 360 por 100.000 habitantes. Debido a esto la comuna de Caldera, retrocedió a Fase de Transición a partir del jueves pasado. En Tierra Amarilla, estimamos un aumento de los casos de un 197% en la última semana, con un R efectivo de 1.26 y una tasa de casos activos estimada de 482 por 100.000 habitantes. 


La fuerte alza de la Región de Coquimbo, es explicada por aumentos importantes en las comunas de La Serena, Coquimbo, Ovalle y Los Vilos


En La Serena estimamos un aumento de los casos de un 13% en la última semana con un R efectivo de 1.37 y una tasa de casos activos estimada de 223 por 100.000 habitantes. Una situación similar se observa en Coquimbo, donde los casos aumentaron en un 25% respecto a la semana anterior, con un R efectivo de 1.32 y una tasa de casos activos estimada de 236 por 100.000 habitantes. 


En Los Vilos los casos aumentaron en un 47% en la última semana con un R efectivo de 1.06 y una tasa de casos activos estimada de 466 casos por 100.000 habitantes. Estas tres comunas retrocedieron a Fase de Transición a partir de ayer jueves. 


En Ovalle estimamos un aumento de los casos de un 14% y una tasa de casos activos estimada de 201 por 100.000 habitantes. Sin embargo, Ovalle se mantiene en fase de Preparación.


Zona Central 


En la Región de Valparaíso, estimamos un aumento de los casos de un 3.8%, que se explica por aumentos importantes en Algarrobo y Cartagena. 


En Algarrobo estimamos aumentos de los casos de un 55% en la última semana con un R efectivo de 1.34 y una tasa de casos activos estimada de 425 por 100.000 habitantes. 


En Cartagena, estimamos un alza de los casos de un 68%, con un R efectivo de 1.33 y una tasa de casos activos de 331 por 100.000 habitantes. 


Además, en las comunas de Valparaíso y Viña del Mar estimamos aumentos de un 18 % y 20% respectivamente con tasas de casos activos mayores a los 350 por 100.000 habitantes.


En la Región de O’Higgins estimamos un fuerte aumento de casos en la última semana, el que se explicado por un aumento de 32% en Rancagua. En esta comuna, el R efectivo además es de 1.24 y la tasa de casos activos es de 273 por 100.000 habitantes. 


Otras comunas de la región que tuvieron fuertes alzas son Coinco, Machalí, Peumo, Rengo, Requinoa, San Vicente y San Fernando. Algunas de estas comunas, como Rancagua, Machalí y Requínoa retrocedieron a Fase de Transición el jueves pasado. 


Además, la Región de O’Higgins es otra de las regiones en las que preocupa el nivel de ocupación de camas críticas. Según último informe la ocupación de camas UCI es de un 96.9%.


En la Región Metropolitana estimamos un aumento de los casos de un 9.4% en la tercera semana del año 2021. 


Su trazabilidad sigue sin mejorar:  sólo se encuentran 2.2 contactos por caso confirmado. De esta manera, la Región Metropolitana es la segunda región del país con peor trazabilidad.


Entre las comunas que más preocupan está La Granja. Acá estimamos un alza de los casos de un 24% en la última semana, con un R efectivo de 1.23 y una tasa de casos activos de 249 casos por 100.000 habitantes. 


También es preocupante Calera de Tango donde estimamos la mayor tasa de casos activos de la región con 256 casos por 100.000 habitantes y el mayor aumento, cinco veces más casos que la semana anterior. Además, Calera de Tango se encuentra entre las 10 comunas con peor trazabilidad de la región, con solo 1.66 contactos detectados por caso confirmado. 


Por otra parte, ayer se informó que las comunas de Ñuñoa, La Reina y Peñalolén avanzan a Fase de Preparación del plan Paso a Paso. En el caso de Ñuñoa, nos preocupe que avance dada la débil trazabilidad que hay en la comuna, pues solo se encuentran 1.5 contactos por caso confirmado.


Las comunas de la Región Metropolitana con mayor tasa de casos nuevos por 100.000 habitantes en la última semana son:

  • Calera de Tango (214) 
  • La Granja (137)
  • Paine (128),
  • Cerrillos (120)
  • Isla de Maipo (116)
  • La Pintana (112)

Además, las comunas metropolitanas con mayor aumento de casos son:

  • Calera de Tango  (408.3%)
  • Isla de Maipo (104.4%)
  • Cerrillos (91.1%)
  • Quilicura (89.2%)
  • Lampa (61.8%)
  • Huechuraba (41.7%)


Finalmente, la ocupación de camas UCI en la Región Metropolitana es de 92.18%, similar al promedio nacional (92.47%). 




Se puede consultar la situación de cada región y sus comunas acá:

Escala de Trazabilidad


La trazabilidad a nivel nacional disminuyó respecto al informe anterior. En esta semana se detectaron 2.7 contactos por cada caso confirmado, esto es una baja de un 3.6% respecto al valor de este indicador en la semana anterior. 


Por segunda semana consecutiva, la región que tuvo la mayor disminución en el indicador de trazabilidad fue Aysén, donde la razón de contactos por caso confirmado bajó en un 10.5% respecto a la semana anterior. 


Por el contrario, la región que más aumentó su trazabilidad en la última semana fue la región de Coquimbo. Aquí el indicador de trazabilidad aumentó en un 13.3% en la última semana. De esta manera, Coquimbo se mantiene por sexta semana consecutiva como la región con la mejor trazabilidad del país, con una razón de 5.2 contactos por caso confirmado. 


Por otra parte, la Región de Los Ríos mantiene la peor trazabilidad del país con solo 2.0 contactos detectados por caso confirmado.


Entre las comunas con más de 25.000 habitantes destacamos a continuación las que tienen mayor y menor valor de este indicador según el último informe de trazabilidad y testeo. 


De acuerdo a estos parámetros destacamos sólo a dos comunas con una trazabilidad exitosa a nivel nacional, Monte Patria y Vicuña. En ambas comunas se encuentran al menos 6 contactos por cada caso confirmado.


A nivel Metropolitano, hay 10 comunas de 52 municipios que cumplen con el mínimo de detección de contactos esperado que es de 3 habitantes por hogar. 


A nivel nacional, las comunas con menores índices de trazabilidad alcanzan rangos desde 1,1 a 1,6 contactos lejos de la cantidad de contactos mínimos, de 3 a 4 habitantes por hogar. En este listado destacan 6 comunas de la Región Metropolitana. 

  • 10 comunas nacionales con mejor trazabilidadMonte Patria, Vicuña, Santa Cruz, Ovalle, Illapel, Coquimbo, La Serena, Las Cabras, Salamanca y Tocopilla. Todas estas comunas tienen al menos 4.5 contactos detectados por cada caso confirmado.
  • 10 comunas nacionales con menor trazabilidadSan Bernardo, La Unión, Valdivia, Llay Llay, Ñuñoa, Santiago, Pedro Aguirre Cerda, Recoleta, Isla de Maipo y Osorno. Todas estas comunas tienen menos de 1,65 contactos detectados, promedio inferior al rango de personas por núcleo familiar.
  • 10 comunas metropolitanas con mejor trazabilidadConchalí, María Pinto, Renca, Til Til, Buin, Alhué, Melipilla, Maipú, Huechuraba y San Pedro. Todas estas comunas tienen al menos 3 contactos detectados por cada caso nuevo confirmado.
  • 10 comunas metropolitanas con menor trazabilidadCalera de Tango, Quilicura, San Ramón, San Bernardo, Ñuñoa, Santiago, San José de Maipo, Pedro Aguirre Cerda, Recoleta e Isla de Maipo. Todas estas comunas tienen menos de 1,66 contactos detectados, promedio inferior al rango de personas por núcleo familiar.
Análisis de trazabilidad:

En el análisis de trazabilidad, ponemos particular interés en la razón de contactos por caso confirmado. Este indicador corresponde al número de contactos que son localizados por cada persona con PCR positivo detectada. 


La idea es que ese valor sea por lo menos entre 3 ó 4 contactos, pues se asume que una persona contagiada tiene al menos esos contactos en su núcleo familiar y el valor recomendado para que el trabajo de trazabilidad sea considerado exitoso es entre 5 a 10 contactos por cada PCR+ confirmado. 

Indicadores usados:


R Instantáneo: La tasa de reproducción instantánea fue calculada a nivel comunal usando el método de Cori implementado en el paquete EpiEstim de R.

Tasa de Casos Activos es calculada cada 100.000 habitantes y corregida por la subestimación en el rezago en el reporte usando el método de Yan & Chowell.

Variación de Casos Estimados: Corresponde a la variación relativa de casos en la semana epidemiológica 2 respecto a la semana epidemiológica 1 del año 2021.

Semana Epidemiológica 2-2021: 10 al 16 de Enero

Semana Epidemiológica 1-2021: 03 al 09 de Enero

Para la creación del semáforo y la etiqueta de comunas en Rojo, Verde y Amarillo se usa un procedimiento de cluster que se basa en los indicadores anteriormente mencionados.

Indice de Trazabilidad: es la razón de contactos por caso.


Imagen: captura de video Un Salmón que Contribuye de Yadrán S.A.



















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Escrito por Voces

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