Fiestas de Fin de Año Arruinan Vacaciones a lo largo de Chile

El Grupo Epidemiológico Matemático para la Vigilancia de Epidemias y Pandemia (GEMVEP) de la Universidad de Santiago publicó su 21º informe de Análisis Regional y Comunal, que usa los datos publicados en el Informe Epidemiológico del Ministerio de Salud del lunes 04 de Enero, para el cálculo de indicadores que se basan en los casos nuevos de las semanas epidemiológicas 52 y 53.

En este nuevo informe estimamos una fuerte alza de casos de Covid-19 en el país en la semana epidemiológica 53, la que corresponde a la última semana del año 2020, de un 26% a nivel nacional, respecto a la semana anterior. De esta manera, hemos acumulado un aumento de los casos en el país de un 98.9% desde la semana epidemiológica 48, a fines de noviembre. Es decir, en las últimas 5 semanas del año 2020 los casos nuevos casi se duplicaron en el país.

La tasa de casos estimada a nivel nacional en la semana epidemiológica 53 es de 120 casos cada 100.000 habitantes. Este es el valor más alto de casos en el país desde la semana epidemiológica 26 (la última de junio), en la que se registraron 141 casos cada 100.000 habitantes.

La regiones en la que estimamos la mayor alza de casos en la última semana respecto a la anterior son:

Antofagasta 74.0%
Atacama 69.8%
Valparaíso 45.4%
Arica 41.3%
Tarapacá 37.2%
Maule 37.0%

En total, estimamos aumentos de casos en 14 de las 16 regiones del país. Sólo no aumentaron sus casos Aysén (-18%) y Ñuble (-11%).

La mayor tasa de casos nuevos cada 100.000 habitantes en la semana epidemiológica 53, la estimamos en las regiones de:

Magallanes 387
Tarapacá 305.4
Los Lagos 278.1
Los Ríos 228.2
Maule 185.2
Biobío 183.14

Regiones del Norte

Una de las regiones que más nos preocupa es Tarapacá, ya que aquí estimamos la segunda más alta tasa de casos del país y también uno de los mayores crecimientos respecto a la semana anterior.

Además, su tasa de casos estimada en la semana epidemiológica 53 es la mayor desde que se inició la pandemia. En esta región estimamos crecimiento en cuatro de sus siete comunas, y tres de ellas son las más pobladas de la región.

En Iquique, estimamos un aumento de los casos de un 42% en la última semana, con un R efectivo de 1.23 y una tasa de casos activos estimada de 580 cada 100.000 habitantes. Una situación similar se observa en Alto Hospicio, aquí estimamos un aumento de los casos de un 30% en esta semana, con un R efectivo de 1.15 y una tasa de casos activos de 495 cada 100.000 habitantes.

Hay que recordar que las comunas de Iquique y Alto Hospicio se encuentran en Cuarentena desde el 4 de Enero. Finalmente, en Pozo Almonte estimamos un crecimiento de los casos de un 39%, con un R efectivo de 1.38 y una tasa de casos activos de 316 cada 100.000 habitantes.

Las restantes regiones del Norte del país no son ajenas a la crítica situación de contagios en Tarapacá. Por ejemplo, en Antofagasta se observó el mayor aumento de casos de esta semana, qué está explicado por un aumento estimado de un 71% en la ciudad de Antofagasta. En esta comuna estimamos un R efectivo de 1.4 y una tasa de casos activos de 291 cada 100.000 habitantes.

En Calama estimamos un aumento de los casos de un 60% en la última semana y un R efectivo de 1.46. Otras comunas de la región en la que estimamos un fuerte aumento de casos son Tocopilla, Tal Tal y San Pedro de Atacama. Tocopilla además es la comuna de más de 25.000 habitantes con el mayor aumento de casos estimado en la semana epidemiológica 53 (417%).

En Atacama, estimamos un fuerte aumento de casos en la comuna de Copiapó, de un 257% en la última semana, con un R efectivo de 1.92 y una tasa de casos activos de 160 cada 100.000 habitantes.

Debido a este fuerte aumento, hoy las autoridades informaron que Copiapó retrocede a Fase 3 del Plan Paso a Paso. De esta manera, la Fase de Apertura Inicial en Copiapó duró exactamente 3 semanas (desde el 17 de Diciembre).

Una situación similar, se observó en la región de Coquimbo. En esta región La Serena, Coquimbo y Los Vilos retrocedieron de Apertura Inicial a Fase de Preparación del Plan Paso a Paso.

En estas comunas la Fase de Apertura Inicial duró dos meses (desde el 2 de Noviembre). Este retroceso se debe a un aumento de los casos de un 30% en la comuna de La Serena y de un 16% en la comuna de Coquimbo. Además, ambas comunas tienen un R efectivo mayor a 1. Por otra parte, en Los Vilos, estimamos un aumento de los casos de un 225% en la última semana con un R efectivo de 1.56 y una tasa de casos activos estimados de 145 cada 100.000 habitantes.

Valparaíso

En Valparaíso el panorama se torna más complejo. Como mencionamos en el párrafo inicial en esta región estimamos un fuerte aumento de casos, que está explicado por un crecimiento de los casos de un 57% en la comuna de Valparaíso. Además, en Valparaíso estimamos un R efectivo de 1.07 y una tasa de casos activos estimada de 260 cada 100.000 habitantes.

Además, en las comunas vecinas de Viña del Mar y Concón estimamos aumentos de un 25% y un 47% respectivamente. Ambas comunas, también con un R efectivo mayor a 1.

Otras comunas de la región para las que estimamos un fuerte aumento son Los Andes, San Esteban, Cabildo, Petorca, Zapallar, Calera, San Antonio, Llay-Llay, Limache, Olmué y Villa Alemana. Entre ellas, Llay-Llay destaca como la quinta comuna de más de 25.000 habitantes con el mayor aumento de casos del país en la última semana (188%).

Regiones del Sur

En la Zona Centro-Sur hemos mirado con mucha preocupación la evolución de los casos en la Región del Maule. En las últimas semanas los casos han aumentado fuertemente, pasando a estar entre las cinco regiones con mayor tasa de contagios del país. El aumento de los casos ha estado explicado mayormente por Curicó, donde estimamos un aumento de los casos de un 42% en la última semana, con un R efectivo de 1.42 y una tasa de casos activos de 719 cada 100.000 habitantes. Curicó también se ubica como la tercera comuna de más de 25.000 habitante del país con mayor tasa de casos nuevos en la semana epidemiológica 53.

Además, esta semana los casos aumentaron en un 27% en la comuna de Talca, con un R efectivo de 1.23 y una tasa de casos activos de 252 cada 100.000 habitantes. Otras comunas de la región en las que los casos han aumentado fuertemente son Maule y San Javier, en las que estimamos aumentos de un 93% y un 51% respectivamente en la última semana. Además, ambas comunas tienen un R efectivo sobre 1 y una tasa de casos activos mayor de 300 casos cada 100.000 habitantes. Por esta razón, las autoridades informaron que ambas comunas retroceden desde el próximo sábado a Cuarentena. De esta manera, ya hay 5 comunas en la región del Maule en fase de Cuarentena (Curicó, Molina, Romeral, Maule y San Javier).

En las regiones del sur de Chile también hemos estimados aumento de casos en la última semana. Esto es muy preocupante, ya que pese a los varios meses en que ha habido gran cantidad de contagios en regiones como Los Lagos, Los Ríos, Magallanes y Bío Bío, estos no logran atenuarse. Pese a que las comunas más pobladas de estas regiones han estado en Cuarentena bastante tiempo.

Por ejemplo, en la Región del Bío Bío estimamos una gran cantidad de casos activos en las comunas de Lota y Coronel. En Lota, estimamos una tasa de casos activos de 726 cada 100.000 habitantes, con un aumento de los casos de un 41% en la última semana y un R de 1.27.

Por otra parte, en Coronel estimamos un aumento de los casos de un 52% en la última semana, un R efectivo de 1 y una tasa de casos activos de 412 cada 100.000 habitantes.

Otras comunas de la región en la que estimamos un fuerte aumento de casos son Hualqui, Mulchén y Hualpén, todas con más de un 30% de casos nuevos que la semana anterior. Debido a esto, las autoridades decidieron retroceder a Fase de Transición la comuna de Mulchén.

En las regiones de Los Ríos y Los Lagos la situación es aún más preocupante ya que al aumento de los casos se le suma que ambas regiones tienen de las peores trazabilidades del país.

En Los Ríos, el indicador de razón de contactos por caso confirmados es de 1.1, por lejos el más bajo del país. Además, en esta región los casos aumentaron fuertemente en la comuna de La Unión. Aquí estimamos un aumento de los casos de un 67% en la última semana, con un R efectivo de 1.73 y una tasa de casos activos estimada de 615 cada 100.000 habitantes. Debido a esto, hoy se anunció que desde el próximo sábado La Unión retrocede a Cuarentena.

Además, en la comuna de Valdivia estimamos un aumento de los casos de un 29% en la última semana, con un R efectivo de 1.16 y una tasa de casos activos de 493 cada 100.000 habitantes. Otras comunas de la región, en las que estimamos aumentos son Corral, Paillaco, Futrono y Lago Ranco.

En Los Lagos, nos preocupa el aumento de casos en la comuna de Calbuco. Aquí estimamos un aumento de los casos de un 143% en la última semana con un R efectivo de 1.48 y una tasa de casos activos de 830 cada 100.000 habitantes. Además, Calbuco destaca como la comuna de más de 25.000 con mayor tasa de casos nuevos en la semana epidemiológica 53 y además por tener una baja trazabilidad, con solo 1.7 contactos por caso confirmado. Pese a todo esto, Calbuco se mantiene curiosamente solo en Fase de Transición.

Otra comuna que nos preocupa en este sentido es Osorno. Aquí estimamos un aumento de los casos de un 64% en la última semana, con un R efectivo de 1.15, una tasa de casos activos de 411 cada 100.000 habitantes y una trazabilidad de 1.5 contactos por caso confirmado (entre las 10 peores del país).

Finalmente, en Puerto Montt estimamos un aumento de los casos de un 30% en la última semana, con un R efectivo de 1.22 y una tasa de casos activos de 571 cada 100.000 habitantes.

Región Metropolitana

En la Región Metropolitana la situación no mejora. En la última semana del 2020 estimamos un aumento de los casos de un 25.7% en esta región. Además, la trazabilidad se mantiene como la segunda peor del país, con solo 2.2 contactos por caso confirmado. Pero aún, la trazabilidad disminuyó en la Región Metropolitana respecto a la semana anterior. Todo esto en el contexto que 21 comunas de la región avanzaron inentendiblemente a Fase 3 del plan Paso a Paso.

Entre las comunas de la región que más preocupan están Vitacura, San Ramón, Santiago y Las Condes. Todas aumentando sus casos, con más de 100 casos activos cada 100.000 habitantes y con una trazabilidad de menos de 1.7 contactos por caso confirmado.

Por ejemplo, en Vitacura estimamos un aumento de los casos de un 23% en la última semana con un R efectivo de 1.18 y una tasa de casos activos estimada de 171 cada 100.000 habitantes.

Además, nos preocupa el fuerte aumento de casos en la última semana en las comunas de Curacaví e Isla de Maipo, en ambas comunas los casos aumentaron a más del doble. Entre las comunas metropolitanas que estimamos un mayor aumento de casos en la semana epidemiológica 53 están:

Curacaví 269.2%
Isla de Maipo 250.0%
Independencia 108.1%
Padre Hurtado 102.7%
Quinta Normal 94.1%
Colina 93.4%

Además, nos preocupa que las comunas de Paine y Pirque avanzaron a Fase 3 con baja trazabilidad y una tasa de casos activos de más de 100 casos cada 100.000 habitantes.

Entre las comunas metropolitanas con mayor tasa de casos activos cada 100.000 habitantes están:

San Joaquín 190
Quinta Normal 181
San Miguel 181
Lo Prado 176
Pudahuel 171
Vitacura 171

Además, nos gustaría destacar a comunas como Buin, Melipilla, Huechuraba y Alhué que han tenido una buena trazabilidad en la última semana y han mantenido una tasa de casos activos bajo la media de la región.

Se puede consultar la situación de cada región y sus comunas acá:

Escala de Trazabilidad

En el análisis de trazabilidad, ponemos particular interés en la razón de contactos por caso confirmado. Este indicador corresponde al número de contactos que son localizados por cada persona con PCR positivo detectada.

La idea es que ese valor sea por lo menos entre 3 ó 4 contactos, pues se asume que una persona contagiada tiene al menos esos contactos en su núcleo familiar y el valor recomendado para que el trabajo de trazabilidad sea considerado exitoso es entre 5 a 10 contactos por cada PCR+ confirmado.

La trazabilidad a Nivel Nacional aumentó respecto al informe anterior. En esta semana los contactos detectados por cada caso confirmado fue de 3.0 a nivel país. Este es un aumento de 0.1 respecto a la semana anterior.

La Región del Ñuble fue la que más aumentó su trazabilidad en esta semana, con un aumento del 37.5%. Mientras que la Región de los Lagos disminuyó su trazabilidad en un 13.8% respecto a la semana anterior.

La región con la peor trazabilidad del país es la región de Los Ríos, aquí solo se encuentran 1.1 contactos por caso confirmado. Por otra parte, Coquimbo es la región que tiene la mejor trazabilidad del país, con 5.2 contactos por caso confirmado.

Entre las comunas con más de 25.000 habitantes destacamos a continuación las que tienen mayor y menor valor de este indicador según el último informe de trazabilidad y testeo.

De acuerdo a estos parámetros destacamos como comunas con una trazabilidad exitosa a nivel nacional a Vallenar, Tocopilla, Illapel, Salamanca, La Cruz, Vicuña, Chimbarongo, Calera y Coquimbo. En cada una de estas comunas se encuentran al menos 6 contactos por cada caso confirmado.

A nivel Metropolitano, hay 8 comunas de 52 municipios que cumplen con el mínimo de detección de contactos esperado que es de 3 habitantes por hogar.

Por el contrario, las comunas con menores índices de trazabilidad a nivel nacional alcanzan rangos desde 0.9 a 1,7 contactos lejos de la cantidad de contactos mínimos, de 3 a 4 habitantes por hogar, entre las que destacan seis comunas de la Región Metropolitana.

A continuación se presenta el resumen de comunas con mejor y peor trazabilidad del país:

10 comunas nacionales con mejor trazabilidad: Vallenar, Tocopilla, Illapel, Salamanca, La Cruz, Vicuña, Chimbarongo, Calera, Coquimbo y Longaví. Todas estas comunas tienen al menos 5.7 contactos detectados por cada caso confirmado, promedio superior al rango de personas por núcleo familiar.
10 comunas nacionales con menor trazabilidad: Las Condes, Lo Barnechea, Osorno, La Granja, San Ramón, Santiago, La Unión, Valdivia, Calera de Tango y Río Bueno. Todas estas comunas tienen menos de 1,7 contactos detectados, promedio inferior al rango de personas por núcleo familiar.
10 comunas metropolitanas con mejor trazabilidad: Buin, Melipilla, Colina, Renca, Alhué, Huechuraba, San Joaquín, Padre Hurtado, Lo Prado y La Reina. Todas estas comunas tienen al menos 2.9 contactos detectados por cada caso nuevo confirmado, promedio igual o superior al rango de personas por núcleo familiar.
10 comunas metropolitanas con menor trazabilidad: El Monte, Vitacura, Las Condes, Lo Barnechea, La Granja, San Ramón, Santiago, San José de Maipo, Calera de Tango y San Pedro. Todas estas comunas tienen menos de 1,75 contactos detectados, promedio inferior al rango de personas por núcleo familiar.

Indicadores usados:

R Instantáneo: La tasa de reproducción instantánea fue calculada a nivel comunal usando el método de Cori implementado en el paquete EpiEstim de R.

Tasa de Casos Activos es calculada cada 100.000 habitantes y corregida por la subestimación en el rezago en el reporte usando el método de Yan & Chowell.

Variación de Casos Estimados: Corresponde a la variación relativa de casos en la semana epidemiológica 53 respecto a la semana epidemiológica 50.

Semana Epidemiológica 53: 27 de Diciembre al 02 de Enero.

Semana Epidemiológica 52: 20 de Diciembre al 26 de Diciembre.

Para la creación del semáforo y la etiqueta de comunas en Rojo, Verde y Amarillo se usa un procedimiento de cluster que se basa en los indicadores anteriormente mencionados.

Indice de Trazabilidad: es la razón de contactos por caso.

Imagen: Municipalidad de Viña del Mar