El Grupo Epidemiológico Matemático para la Vigilancia de Epidemias y Pandemia (GEMVEP) de la Universidad de Santiago publicó su 22º informe de Análisis Regional y Comunal, que usa los datos publicados en el Informe Epidemiológico del Ministerio de Salud del Lunes 11 de Enero, para el cálculo de indicadores que se basan en los casos nuevos de las semanas epidemiológicas 53 del año 2020 y en la semana epidemiológica 1 del año 2021.
En este nuevo informe miramos con mucha preocupación como los casos de Covid-19 siguen creciendo a una velocidad muy rápida en el país. En la primera semana epidemiológica del año 2021, estimamos un aumento de casos a nivel nacional de un 35.5% respecto a la última semana del año 2020.
Con el aumento de esta semana, acumulamos un alza de casos de Covid-19 de un 101.3% en las últimas 3 semanas. Es decir, en la primera semana de 2021 tenemos el doble de casos que los que habían en la semana anterior a Navidad.
La tasa de casos estimada a Nivel Nacional en la primera semana del año 2021 es de 173 casos cada 100.000 habitantes. Esta tasa es la más alta desde la Semana Epidemiológica 25 (mediados de Junio del 2020).
Este preocupante aumento de casos es explicado mayormente por las regiones, sin contar la Metropolitana, donde los casos aumentaron en un 38.3% en la última semana. La tasa de casos nuevos estimada para las regiones en la primera semana del año 2021 es de 229 casos cada 100.000 habitantes. Esta es la mayor tasa que han tenido las regiones desde el inicio de la pandemia.
En el detalle por región, en el informe de la primera semana del año, estimamos alzas de casos en las 16 regiones del país.
La regiones en la que estimamos el mayor aumento de casos en la última semana se destacan dos regiones del Norte Grande con más de 80% de crecimiento:
Arica y Parinacota (83.9%)
Antofagasta (81%)
Aysen (66.9%)
Los Lagos (65.9%)
Los Ríos (64.8%)
Tarapaca (55.0%).
En la primera semana del año 2021, la mayor tasa de casos nuevos cada 100.000 habitantes la estimamos en las regiones de:
- Tarapacá 514
- Los Lagos 502
- Magallanes 488
- Los Ríos 416
- Antofagasta 283
- Biobío 247
En total 13 de 16 regiones tienen más de 100 casos nuevos cada 100.000 habitantes. Bajo este umbral solo están la Región Metropolitana (94 casos cada 100.000 habitantes), Atacama (91) y Coquimbo (82).
También, en las 16 regiones del país, estimamos una tasa de incidencia diaria mayor a los 10 casos cada 100.000 habitantes, que es el umbral que define el plan Paso a Paso para retroceder de Transición a Cuarentena.
En base a estos indicadores, las regiones que más nos preocupan en este informe son Tarapacá y Los Lagos. Ambas tuvieron aumentos muy fuertes en la última semana y tienen tasas muy altas de contagios.
En la Región de Tarapacá, estimamos aumentos en 5 de las 7 comunas de la región.
En la capital regional, Iquique, estimamos un aumento de los casos de un 46% en la última semana con un R efectivo de 1.4 y una tasa de casos activos de 900 cada 100.000 habitantes.
Una situación similar se observa en Alto Hospicio, aquí estimamos un aumento de los casos de un 55% en la última semana, con un R efectivo de 1.35 y una tasa de casos activos estimada de 809 cada 100.000 habitantes.
Ambas ciudades destacan entre las 10 comunas con más de 25.000 con las mayores tasas de casos en la primera semana del año 2021. Es importante recordar que Iquique y Alto Hospicio iniciaron su cuarentena el Lunes 4 de Enero, por lo que en este informe ya estamos considerando los casos con inicio de síntomas en la primera semana de máximo confinamiento.
Por otra parte, el aumento en la Región de Los Lagos está explicado por aumentos en 26 de las 30 comunas de la región.
En Puerto Montt, estimamos un aumento de los casos de un 53% en la última semana, con un R efectivo de 1.45 y una tasa de casos activos estimada de 894 cada 100.000 habitantes. Además, en la comuna vecina de Puerto Varas estimamos un aumento de los casos de un 72% en la última semana, con un R efectivo de 1.23 y una tasa de casos activos estimada de de 613 cada 100.000 habitantes.
En la segunda ciudad más poblada de la región, Osorno, estimamos un aumento de los casos de un 62% en la última semana epidemiológica con un R efectivo de 1.57 y una tasa de casos activos estimada de 655 cada 100.000 habitantes.
Otros aumentos importantes que estimamos en esta región fueron en las comunas de Calbuco y Quellón. En Calbuco, estimamos un aumento de los casos de un 50% en la última semana y un R efectivo de 1.65. En Quellón, en cambio, estimamos un aumento de los casos de un 34% en la última semana con un R efectivo de 2.52. En ambas localidades, estimamos una tasa de casos activos mayor a los 1.200 casos cada 100.000 habitantes.
La Región de Los Lagos, tiene 3 de las 5 comunas en las que estimamos la mayor cantidad de casos cada 100.000 habitantes en la primera semana del 2021 (Calbuco, Quellón y Puerto Montt). Debido a esta situación muy crítica, todas las comunas anteriormente mencionadas iniciaron su Cuarentena el día de hoy, a la espera de que en esta oportunidad esta medida si sea útil para disminuir la alta cantidad de casos de la región (no como la primera cuarentena).
Regiones Extremas
Como mencionamos en los párrafos iniciales, los casos aumentaron en las 16 regiones del país. Sin embargo, las mayores alzas se observaron en la zonas extremas. Por ejemplo, en Arica estimamos un fuerte aumento de casos, de 85% en la última semana, con un R efectivo de 1.53 y una tasa de casos activos estimada de 267 cada 100.000 habitantes.
Además, la Región de Arica - que generalmente se caracterizó por tener una buena trazabilidad - fue donde disminuyó más fuertemente su trazabilidad. Esto en el contexto de la suspensión de la estrategia de trazabilidad en la comuna de Arica. Realmente, un panorama muy preocupante.
En el otro extremo del país, en la Región de Aysén, el aumento explicado principalmente, por un fuerte crecimiento de casos en la comuna de Aysén, seis veces más respecto a la semana anterior. Esta fue la segunda mayor alza de casos del país en la primera semana del año 2021 entre las comunas de más de 25.000 habitantes. Aysén también está entre las 24 comunas del país que iniciaron su Cuarentena el día de hoy.
Otra de las regiones que tuvo un alza importante en esta semana fue la Región de Antofagasta. En la ciudad de Antofagasta estimamos un aumento de los casos de un 72% en la última semana, con un R efectivo de 1.78 y una tasa de casos activos estimada de 565 cada 100.000 habitantes. Además, en la segunda ciudad más poblada de la región, Calama, estimamos un aumento de los casos de un 155% en la última semana, con un R efectivo de 2.19 y una tasa de casos activos estimada de 180 cada 100.000 habitantes.
Otras comunas de la región para las que estimamos alzas fuertes son Mejillones y San Pedro de Atacama. Las comunas de Mejillones y Antofagasta iniciaron su Cuarentena el día de hoy. Sin embargo, Calama se mantiene en Fase de Transición.
Norte Chico
Para las regiones de Atacama, Coquimbo y Valparaíso estimamos alzas en sus comunas más pobladas. Entre ellas, nos preocupa fuertemente los aumentos de casos en las comunas de Valparaíso y Viña del Mar.
En Valparaíso, estimamos un aumento de los casos de un 55% en la última semana, con un R efectivo de 1.5 y una tasa de casos activos estimada de 445 cada 100.000 habitantes.
En Viña del Mar, estimamos un aumento de los casos de un 33% en la primera semana de 2021, con un R efectivo de 1.47 y una tasa de casos activos estimada de 290 cada 100.000 habitantes.
Entre estas regiones, otra comuna para la que nos preocupa el aumento de casos es Copiapó. En esta comuna, estimamos un aumento de casos de un 65% en la última semana, con un R efectivo de 2.01 y una tasa de casos activos estimada de 213 cada 100.000 habitantes.
Finalmente, en las comunas de Coquimbo y La Serena estimamos aumentos de un 35% y 78% respectivamente en la última semana, pero con tasas de casos activos aún bajas respecto a las capitales de las regiones vecinas.
Zona Sur
En el sur del país, nos preocupa mucho la situación en la Región de Los Ríos, donde estimamos aumentos de casos en 11 de sus 12 comunas.
En Valdivia, estimamos un aumento de los casos de un 52% en la última semana con un R efectivo de 1.38 y una tasa de casos activos estimada de 768 cada 100.000 habitantes. Además, estimamos fuertes alzas para las comunas de Los Lagos, Paillaco, La Unión y Futrono.
Hay que recordar que la Región de Los Ríos además es la que tiene los peores indicadores de trazabilidad del país hace más de un mes. En este sentido, con los datos del último informe, nos sigue preocupando la baja trazabilidad en las comunas de Valdivia y La Unión, que destacan en el listado de las 10 peores trazabilidades del país. Estas mismas comunas, además están en el listado de las 10 tasas de casos nuevos más altas de la primera semana del 2021. Debido a estos críticos indicadores, las comunas de Valdivia y La Unión (además de la comuna de Lago Ranco) iniciaron su Cuarentena hoy. De nuevo a la espera, de que la Cuarentena realmente funcione.
En la Región de Biobío, estimamos un importante aumento de casos en la comuna de Concepción, de un 36% en la última semana, con un R efectivo de 1.09 y una tasa de casos activos estimada de 453 cada 100.000 habitantes.
Una situación similar se observa en la comuna de Talcahuano, donde estimamos un aumento de los casos de 43% en la última semana, con un R efectivo de 1.13 y una tasa de casos activos estimada de 562 cada 100.000 habitantes.
Finalmente, la comuna de Lota destaca entre las 10 comunas con mayores tasas de casos en la primera semana del año 2021. En esta semana, los casos aumentaron en un 16% en la última semana, con un R efectivo de 1.11 y una tasa de casos activos estimada de 855 cada 100.000 habitantes.
Para cerrar el análisis de la zona sur, es importante destacar el daño que se le hizo a las comunas de estas regiones al levantar la cuarentena previo a las fiestas de fin de año. Debido a las alzas de casos en las semanas de las fiestas de fin año, Temuco y Valdivia retrocedieron a Cuarentena luego de 3 semanas, Puerto Montt luego de 5 semanas y Concepción luego de 3 meses. En estas comunas, la Fase de Transición permitió aumento gradual de los casos.
Región Metropolitana
Finalmente, en la Región Metropolitana la situación sigue empeorando. En la primera semana del año 2021 estimamos un aumento de los casos de un 26.8%. Además, la trazabilidad empeoró respecto a la semana anterior: el indicador de razón de contactos por caso confirmado disminuyó de 2.2 a 2.0 en esta región.
Entre las comunas que más preocupan de la región está Vitacura, en la que estimamos la tercera mayor tasa de casos activos de la región y la peor trazabilidad del país. Acá el aumento de los casos fue de un 113% en la última semana, con un R efectivo de 1.12 y una tasa de casos activos de 222 casos cada 100.000 habitantes. Además, en Vitacura solo se encuentran 0.6 contactos por caso confirmado.
También nos preocupa el fuerte aumento de casos en la comuna de El Monte, de un 244% en la última semana, con un R efectivo de 2.2 y una tasa de casos activos de 182 cada 100.000 habitantes.
Así, las comunas metropolitanas en que estimamos un mayor aumento de casos en la primera semana de 2021 son:
- El Monte 244%
- Cerrillos 130%
- Lo Barnechea 128%
- Recoleta 120%
- Vitacura 113%
Asimismo, las comunas metropolitanas con mayor tasa de casos nuevos cada 100.000 habitantes son:
- Vitacura 152
- El Monte 142
- Lo Barnechea 141
- Quinta Normal 140
- Renca 135
- La Pintana 133
Además, queremos seguir destacando la buena labor de trazabilidad de las comunas de Buin, Conchalí y Huechuaraba, las que además mantienen una tasa de casos activos bajo la media de la Región Metropolitana. Hay que recordar que este jueves retrocedieron a Fase 2 las comunas de Recoleta, Buin y La Pintana en la Región Metropolitana.
Se puede consultar la situación de cada región y sus comunas acá:
- Región de Arica y Parinacota
- Región de Tarapacá
- Región de Antofagasta
- Región de Atacama
- Región de Coquimbo
- Región de Valparaíso
- Región Metropolitana
- Región de O'Higgins
- Región del Maule
- Región del Ñuble
- Región del Biobío
- Región de La Araucanía
- Región de Los Ríos
- Región de Los Lagos
- Región de Aysén
- Región de Magallanes
Escala de Trazabilidad
En el análisis de trazabilidad, ponemos particular interés en la razón de contactos por caso confirmado. Este indicador corresponde al número de contactos que son localizados por cada persona con PCR positivo detectada.
La idea es que ese valor sea por lo menos entre 3 ó 4 contactos, pues se asume que una persona contagiada tiene al menos esos contactos en su núcleo familiar y el valor recomendado para que el trabajo de trazabilidad sea considerado exitoso es entre 5 a 10 contactos por cada PCR+ confirmado.
La trazabilidad a nivel nacional disminuyó fuertemente respecto al informe anterior. En esta semana los contactos detectados por cada caso confirmado fue de 2.7 a Nivel País, un 10% menos que en la semana anterior. Además, este indicador disminuyó en 15 de las 16 regiones del país.
La región con mayor disminución de trazabilidad fue Arica y Parinacota. Aquí la razón de contactos por caso confirmado disminuyó en un 23.8%. La única región que aumentó su trazabilidad en la última semana fue la región de Los Ríos, que pese a un alza de un 54.5% en la última semana, la región de Los Ríos mantiene la peor trazabilidad del país con solo 1.7 contactos por caso confirmado.
En cambio Coquimbo es, por cuarta semana consecutiva, la región que tiene la mejor trazabilidad del país, con 5.2 contactos por caso confirmado.
Entre las comunas con más de 25.000 habitantes destacamos a continuación las que tienen mayor y menor valor de este indicador según el último informe de trazabilidad y testeo.
De acuerdo a estos parámetros destacamos como comunas con una trazabilidad exitosa a nivel nacional a Tocopilla, Chimbarongo, Coquimbo y Salamanca. En cada una de estas comunas se encuentran al menos 6 contactos por cada caso confirmado.
A nivel Metropolitano, hay 5 comunas de 52 municipios que cumplen con el mínimo de detección de contactos esperado que es de 3 habitantes por hogar.
Por el contrario, las comunas con menores índices de trazabilidad a nivel nacional alcanzan rangos desde 0.6 a 1,5 contactos lejos de la cantidad de contactos mínimos, de 3 a 4 habitantes por hogar, entre las que destacan 7 comunas de la Región Metropolitana.
A continuación se presenta el resumen de comunas con mejor y peor trazabilidad del país:
- 10 comunas nacionales con mejor trazabilidad: Tocopilla, Chimbarongo, Coquimbo, Salamanca, Buin, Vallenar, Mulchén, Collipulli, Conchalí y Aysén. Todas estas comunas tienen al menos 4.9 contactos detectados por cada caso confirmado.
- 10 comunas nacionales con menor trazabilidad: Quilicura, Valdivia, Calbuco, La Granja, El Monte, Lo Barnechea, Santiago, La Unión, San Ramón y Vitacura. Todas estas comunas tienen menos de 1,46 contactos detectados, promedio inferior al rango de personas por núcleo familiar.
- 10 comunas metropolitanas con mejor trazabilidad: Buin, Conchalí, Huechuraba, Renca, San Joaquín, Lo Prado, Melipilla, Padre Hurtado, Colina y Macul. Todas estas comunas tienen al menos 2.7 contactos detectados por cada caso nuevo confirmado.
- 10 comunas metropolitanas con menor trazabilidad: Pirque, Quilicura, San José de Maipo, La Granja, Til Til, El Monte, Lo Barnechea, Santiago, San Ramón y Vitacura. Todas estas comunas tienen menos de 1,47 contactos detectados, promedio inferior al rango de personas por núcleo familiar.
Indicadores usados:
R Instantáneo: La tasa de reproducción instantánea fue calculada a nivel comunal usando el método de Cori implementado en el paquete EpiEstim de R.
Tasa de Casos Activos es calculada cada 100.000 habitantes y corregida por la subestimación en el rezago en el reporte usando el método de Yan & Chowell.
Variación de Casos Estimados: Corresponde a la variación relativa de casos en la semana epidemiológica 54 respecto a la semana epidemiológica 53.
Semana Epidemiológica 54: 03 al 09 de Enero
Semana Epidemiológica 53: 27 de Diciembre al 02 de Enero.
Para la creación del semáforo y la etiqueta de comunas en Rojo, Verde y Amarillo se usa un procedimiento de cluster que se basa en los indicadores anteriormente mencionados.
Indice de Trazabilidad: es la razón de contactos por caso.
Imagen: Mall Arauco Maipú, 21 de diciembre. Crédito: @nelivana
Escrito por Voces
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