El Grupo Epidemiológico Matemático para la Vigilancia de Epidemias y Pandemia (GEMVEP) de la Universidad de Santiago publicó su 18º informe de Análisis Regional y Comunal, que usa los datos publicados en el Informe Epidemiológico del Ministerio de Salud del Lunes 30 de Noviembre, para el calculo de indicadores que se basan en los casos nuevos de las semanas epidemiológicas 47 y 48.
En el informe de hoy destacamos una nueva alza de casos a nivel nacional: en la Semana Epidemiológica 48, estimamos un aumento de los casos en un 4.1% respecto a la semana anterior.
De esta manera, han pasado 4 semanas desde la menor cantidad de casos reportada desde Mayo. En estas 4 semanas los casos han aumentado en promedio en un 4.87% a nivel nacional.
Este aumento está explicado por el alza estimada en 10 de las 16 regiones del país, siendo la con mayor alza, por segunda semana consecutiva, la Región de Coquimbo, donde estimamos un aumento de los casos de un 48% en la Semana Epidemiológica 48 respecto a la semana anterior.
Además, los casos aumentaron fuertemente en:
- Tarapacá (39.8%)
- Valparaíso (22.4%)
- Atacama (18.5%)
- BioBío (16.2%)
- Región Metropolitana (8.7%)
Por otro lado, finalmente estamos estimando descenso de casos en las regiones de La Araucanía (-4.5%), Los Ríos (-19.7%) y Los Lagos (-17%).
Las regiones para las que estimamos las mayores tasa de casos activos cada 100.000 habitantes del país, destaca BioBío que saltó de la 5º a la 2º posición en una semana:
- Magallanes (358.26)
- BioBío ((138.07)
- Los Ríos (133.3),
- Los Lagos (128.78)
- La Araucanía (112.88)
- Ñuble (99.70)
Así vemos que en la última semana epidemiológica tanto en el Norte como en el Sur del país se registran aumentos importantes de casos y más grave aún, dos de las regiones más pobladas del país - Metropolitana y Valparaíso - muestran fuertes alzas.
Misma semana en que el ministro de Salud Enrique Paris causa pavor anunciando que "si viene una segunda ola será mucho más grande" y pronostica "un colapso gravísimo en el sistema hospitalario" (aunque nunca nunca hemos salido de la primera ola) y en paralelo se abren fronteras, se impulsa el turismo, la Primera Dama Cecilia Morel anuncia el regreso del programa Vacaciones Tercera Edad de Sernatur y el mismo ministro Paris sólo desaconseja, hace dos días, tomar vacaciones en el Sur.
De acuerdo a este balance regional, tenemos particular preocupación por el aumento de casos en la Región del BioBío:
En Concepción, la capital de la región, los casos aumentaron en un 11% en la Semana Epidemiológica 48. En esta ciudad la tasa de casos activos es de 289 casos cada 100.000 habitantes.
Además, la mayor parte de las comunas del Gran Concepción aumentaron sus casos. Por ejemplo, en San Pedro de la Paz estimamos un aumento de los casos de un 19% en esta semana, con un R efectivo de 1.11 y una tasa de casos activos de 364 casos cada 100.000 habitantes.
En Talcahuano estimamos un aumento de casos de un 24% en la última semana y una tasa de casos activos de 308 casos cada 100.000 habitantes.
Los aumentos más preocupantes los estimamos en Lota, Penco y Tomé:
En Lota los casos aumentaron en un 81% en la última semana, con un R efectivo de 1.12 y una tasa de casos activos de 282 casos cada 100.000 habitantes. Hay que recordar que Lota salió de Cuarentena el Lunes recién pasado, por lo que esta estimación aún considera el periodo en que esta comuna estaba en Cuarentena.
En Tomé, los casos aumentaron en un 80%, con un R efectivo de 1.08 y una tasa de casos activos de 221 casos cada 100.000 habitantes.
En Penco los casos aumentaron en un 75% en la última semana, con un R efectivo de 0.99 y una tasa de casos activos de 162 casos cada 100.000 habitantes.
Además, en esta región nos preocupan aumentos importantes de casos en Florida, Arauco, Tirúa, Cabrero, Laja, Negrete, Quileco y Santa Bárbara.
En la región vecina del Ñuble, los casos nuevamente aumentaron. En la semana epidemiológica 48 los casos subieron en un 4.5% respecto a la semana anterior. Con esta alza, la región del Ñuble se ubica con la 6ta mayor tasa de casos activos del país.
Esta nueva alza esta explicada en parte por el aumento de casos en Chillán, donde estimamos un aumento de casos de un 16% en la última semana, con un R efectivo de 1.14 y una tasa de casos activos de 306 casos cada 100.000 habitantes.
Además, los casos aumentaron fuertemente en las comunas de Bulnes y Pinto:
En Bulnes, los casos aumentaron en un 51%, con un R efectivo de 1.14 y una tasa de casos activos de 102 casos cada 100.000 habitantes. En Pinto, los casos aumentaron en un 62% con un R efectivo es de 1.67 y una tasa de casos activos de 84 casos cada 100.000 habitantes.
Regiones del Norte
En el norte del país, los casos vuelven a subir en las regiones de Coquimbo, Tarapacá y Atacama.
En la cuarta región del país, los casos aumentaron fuertemente en la ciudad de Coquimbo. Aquí, estimamos un aumento de casos de un 60% en la última semana, con un R efectivo de 1.56 y una tasa de casos activos de 46 casos cada 100.000 habitantes.
Además, en las comunas de Andacollo, Illapel, Salamanca, Monte Patria y Punitaqui estimamos aumentos de casos mayores al 100% y R efectivos muy superiores a 1. Sin embargo, las tasas de casos activos activos en estas localidades aún son bajas.
Entre las tasas de casos activos más altas de la región esta la ciudad de Ovalle. Aquí, los casos aumentaron en un 31% la última semana con un R efectivo de 1.46 y una tasa de casos activos de 125 casos cada 100.000 habitantes.
En Tarapacá, preocupa un nuevo aumento de casos en las 3 comunas más pobladas de la región: Iquique, Alto Hospicio y Pozo Almonte:
En Iquique, los casos aumentaron en un 47% en la última semana, con un R efectivo de 1.02 y una tasa de casos activos de 186 casos cada 100.000 habitantes.
En Alto Hospicio, los casos aumentaron en un 24% en la última semana, con un R efectivo de 1.02 y una tasa de casos activos de 120 casos cada 100.000 habitantes.
Y en Pozo Almonte los casos aumentaron en un 119% en la última semana y la tasa de casos activos llegó a 75 casos cada 100.000 habitantes.
En Atacama, el aumento de casos esta explicado por un alza de casos de un 99% en la última semana en Copiapó, con un R efectivo de 1.23 y una tasa de casos activos de 23 casos cada 100.000 habitantes.
Además, en Vallenar, los casos también aumentaron en un 19% en la última semana con una tasa de casos activos de 92 casos cada 100.000 habitantes.
Regiones del Sur
En las regiones del sur del país, al fin los indicadores empiezan a mostrar una baja en los casos en las regiones de La Araucanía, Los Ríos y Los Lagos.
En La Araucanía, los casos disminuyeron en un 39% en Temuco en la última semana. La tasa de casos activos en esta comuna es de 265 casos cada 100.000 habitantes.
En la Región de Los Ríos, los casos disminuyeron en un 12% en Valdivia. Aquí, la tasa de casos activos es de 359 casos cada 100.000 habitantes. Esperando que los casos se mantengan a la baja en las próximas semanas en esta región, urge que la trazabilidad se mejore en esta región. Según la razón de contactos por caso confirmado, Los Ríos tiene la peor trazabilidad del país: solo se encuentran 1.7 contactos por caso confirmado.
En Los Lagos los casos disminuyeron en un 13% en la última semana en Puerto Montt. Esto llevó a que las autoridades decidieran levantar la Cuarentena en esta comuna. Luego de esta decisión, el próximo lunes 7 de diciembre se terminará una Cuarentena que duró 131 días en esta ciudad, vigente desde el 29 de julio al 07 de diciembre.
Sin embargo, no es el momento de relajarse en Puerto Montt, ya que la tasa de casos activos sigue siendo alta (274 casos cada 100.000 habitantes).
Además, en las comunas de la provincia de Chiloé y Osorno los casos también disminuyeron en la última semana. En esta región, nos preocupa el aumento de casos en Frutillar y Puerto Varas. En Frutillar los casos aumentaron en un 126% en la última semana, con un R efectivo de 1.37 y una tasa de casos activos 163, mientras que en Puerto Varas los casos aumentaron en un 33% en la última semana y la tasa de casos activos es de 193 casos cada 100.000 habitantes.
Regiones más pobladas
En Valparaíso y Metropolitana, dos de las regiones más pobladas del país, los casos aumentaron fuertemente en la última semana.
En Valparaíso, el aumento está explicado en parte, por un aumento de casos de un 23% en la última semana en la comuna de Valparaíso. Además, en esta comuna el R efectivo es de 1.24 y la tasa de casos activos estimada es de 147 casos cada 100.000 habitantes.
Otras comunas de la región que tuvieron un fuerte aumento en la última semana son: Puchuncaví, Quintero, Calle Larga, Cabildo, Zapallar, Hijuelas, Algarrobo y Llay Llay.
En todas estas comunas, los casos confirmados aumentaron en más del doble. Preocupan particularmente Zapallar y Algarrobo.
En Zapallar los casos aumentaron en un 125% en la última semana, con un R efectivo de 2.74 y una tasa de casos activos de 163 casos cada 100.000 habitantes. En Algarrobo, los casos aumentaron en un 263% en la última semana, con un R efectivo de 2.87 y una tasa de casos activos de 132 cada 100.000 habitantes.
En la Región Metropolitana, hubo un fuerte aumento de casos en la comuna de Santiago, donde los casos aumentaron en un 40% en la última semana, con un R efectivo de 1.59 y una tasa de casos activos de 57 casos cada 100.000 habitantes. Este aumento de casos provocó que las autoridades decidieran que esta comuna retrocediera de Apertura Inicial a Preparación, junto con Vitacura, Las Condes y Curacaví.
Además, Santiago sigue destacando como la tercera comuna del país con peor trazabilidad: solo se encuentran 1.5 contactos por caso confirmado. Con este nivel de trazabilidad será muy difícil controlar la alza de esta semana.
En Vitacura se vive una situación es similar. Los casos aumentaron en un 19% en la última semana, con un R efectivo de 1.29, una tasa de casos activos de 52 casos cada 100.000 habitantes. Ello junto a una pobre trazabilidad: 1.9 contactos por caso confirmado.
Además, las autoridades informaron que las comunas de Pedro Aguirre Cerda, Pudahuel, La Pintana y Cerro Navia retrocedieron a Fase de Transición.
Para Pudahuel, La Pintana y Cerro Navia estimamos aumentos de casos de un 38%, 11% y 10% respectivamente, con R efectivos mayores a 1 en los 3 casos.
Además, Cerro Navia preocupa ya que tiene la segunda tasa más alta de casos activos de la región (102 casos cada 100.000 habitantes).
Sin embargo, Pedro Aguirre Cerda retrocedió a Transición pese a disminuir sus casos en un 11% y con una tasa de casos activos menor a la de Ñuñoa, que aún está en Fase 4 (Apertura Inicial) del plan Paso a Paso.
Se puede consultar la situación de cada región y sus comunas acá:
- Región de Arica y Parinacota
- Región de Tarapacá
- Región de Antofagasta
- Región de Atacama
- Región de Coquimbo
- Región de Valparaíso
- Región Metropolitana
- Región de O'Higgins
- Región del Maule
- Región del Ñuble
- Región del Biobío
- Región de La Araucanía
- Región de Los Ríos
- Región de Los Lagos
- Región de Aysén
- Región de Magallanes
Escala de Trazabilidad
En el análisis de trazabilidad, ponemos particular interés en la razón de contactos por caso confirmado. Este indicador corresponde al número de contactos que son localizados por cada persona con PCR positivo detectada.
La idea es que ese valor sea por lo menos entre 3 ó 4 contactos, pues se asume que una persona contagiada tiene al menos esos contactos en su núcleo familiar y el valor recomendado para que el trabajo de trazabilidad sea considerado exitoso es entre 5 a 10 contactos por cada PCR+ confirmado.
Entre las comunas con más de 25.000 habitantes destacamos a continuación las que tienen mayor y menor valor de este indicador según el último informe de trazabilidad y testeo.
De acuerdo a estos parámetros destacamos como comunas con una trazabilidad exitosa a nivel nacional a Mostazal, Illapel, Arica, Quellón, Vicuña, Quillota y La Cruz. En cada una de estas comunas se encuentran más de 7 contactos por cada caso confirmado.
La Región Metropolitana continúa sin tener trazabilidad exitosa y solo 16 de sus 52 municipios que cumplen con el mínimo de detección de contactos esperado que es de 3 habitantes por hogar.
Las comunas con menores índices de trazabilidad a nivel nacional alcanzan rangos desde 1 a 1,77 contactos lejos de la cantidad de contactos mínimos, de 3 a 4 habitantes por hogar, entre las que destacan 8 municipios de la Región Metropolitana.
- 10 comunas nacionales con mejor trazabilidad: Mostazal, Illapel, Arica, Quellón, Vicuña, Quillota, La Cruz, Salamanca, Rengo y San Carlos. Todas estas comunas tienen al menos 6.6 contactos detectados por cada caso confirmado, promedio superior al rango de personas por núcleo familiar.
- 10 comunas nacionales con menor trazabilidad: Peñalolén, La Granja, San Bernardo, San Miguel, Providencia, Pirque, La Unión, Santiago, Independencia y Requínoa. Todas estas comunas tienen menos de 1,77 contactos detectados, promedio inferior al rango de personas por núcleo familiar.
- 10 comunas metropolitanas con mejor trazabilidad: María Pinto, Buin, Curacaví, Isla de Maipo, El Monte, Talagante, La Reina, Conchalí, Calera de Tango y Renca. Todas estas comunas tienen más de 3,67 contactos detectados por cada caso nuevo confirmado, promedio igual o superior al rango de personas por núcleo familiar.
- 10 comunas metropolitanas con menor trazabilidad: El Bosque, La Florida, Peñalolén, La Granja, San Bernardo, San Miguel, Providencia, Pirque, Santiago e Independencia. Todas estas comunas tienen menos de 1,81 contactos detectados, promedio inferior al rango de personas por núcleo familiar.
Indicadores usados:
R Instantáneo: La tasa de reproducción instantánea fue calculada a nivel comunal usando el método de Cori implementado en el paquete EpiEstim de R.
Tasa de Casos Activos es calculada cada 100.000 habitantes y corregida por la subestimación en el rezago en el reporte usando el método de Yan & Chowell.
Variación de Casos Estimados: Corresponde a la variación relativa de casos en la semana epidemiológica 48 respecto a la semana epidemiológica 47.
Semana Epidemiológica 48: 22 al 28 de Noviembre.
Semana Epidemiológica 47: 15 al 21 de Noviembre.
Para la creación del semáforo y la etiqueta de comunas en Rojo, Verde y Amarillo se usa un procedimiento de cluster que se basa en los indicadores anteriormente mencionados.
Indice de Trazabilidad: es la razón de contactos por caso.
Crédito imagen: Sernatur
Escrito por Voces
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